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  • 中華絨螯蟹生態(tài)育苗池塘細菌群落分析

    作者:徐宇; 鄧燕飛; 楊志強; 葛家春; 楊鳶劼 江蘇省淡水水產(chǎn)研究所; 江蘇南京210017; 江蘇省淡水水產(chǎn)種質(zhì)資源保護與利用重點實驗室; 江蘇南京210017; 江蘇省農(nóng)業(yè)種質(zhì)資源保護與利用平臺; 江蘇南京210014; 南京淳一水產(chǎn)科技發(fā)展有限公司; 江蘇高淳211316

    摘要:為探究江蘇省射陽地區(qū)沿海灘涂中華絨螯蟹(Eriocheir sinensis)生態(tài)育苗池塘細菌群落結(jié)構(gòu),分別對養(yǎng)殖池塘水體(S7,S8,S9)和池塘底泥(N7,N8,N9)細菌群落16SrDNA的V3、V4、V5可變區(qū)進行擴增,檢測合格的文庫進行高通量測序;利用Qiime(v1.7)軟件,對序列閾值97%相似性水平進行聚類分析;分別以門、綱、目、科和屬的分類水平對樣本進行α-多樣性指數(shù)分析;以Chaol指數(shù)和Shannon指數(shù)評估菌種豐富度和多樣性。結(jié)果表明,3個生態(tài)育苗池塘得到OTU分別為8 881、7 406、8 566個。S7微生物歸屬于16門、29綱、58目、97科、191屬;S8為9門、18綱、38目、68科、132屬;S9為17門、32綱、60目、111科、227屬。N7為41門、103綱、198目、325科、572屬;N8為42門、103綱、203目、318科、534屬;N9為40門、99綱、196目、323科、578屬。養(yǎng)殖水體優(yōu)勢菌群以變形菌門(Proteobacteria)為主,其次是擬桿菌門(Bacteroidetes);池塘底泥優(yōu)勢菌群以變形菌門為主,其次為擬桿菌門、綠彎菌門(Chloroflexi)和浮霉菌門(Planctomycetes)。養(yǎng)殖池塘底泥中細菌群落的豐富度和物種多樣性明顯高于養(yǎng)殖水體,水體中細菌群落的豐富度S9>S7>S8,物種的多樣性S7>S9>S8。池塘底泥中細菌群落的豐富度N7>N9>N8,物種的多樣性N7> N9>N8。

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    水生態(tài)學(xué)

    北大期刊 下單

    國際刊號:1674-3075

    國內(nèi)刊號:42-1785/X

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